Hesaplamalı Biyoloji ile Verinizin Gücünü Keşfedin
Modern biyomedikal araştırmalar, yalnızca laboratuvar verileriyle değil; bu verilerin doğru, kapsamlı ve bütüncül analizleriyle anlam kazanır. In silico yaklaşımlar — yani bilgisayar destekli modelleme, simülasyon ve veri analiz yöntemleri — biyolojik süreçleri daha derinlemesine anlamanızı sağlar, deney maliyetlerini azaltır ve öngörü gücünü artırır.
Kurum olarak; biyoinformatik, istatistiksel analiz ve hesaplamalı biyoloji alanlarında güçlü bir altyapı sunuyor, proje verilerinizi bilimsel yayın niteliğinde sonuçlara dönüştürmeniz için profesyonel destek sağlıyoruz.
🔬 Hizmet Kapsamımız
🧬 Genom, transkriptom ve proteom verilerinin analizi
💻 RNA-seq, microarray ve NGS verilerinin işlenmesi
🔍 Gen ekspresyon profili oluşturma, diferansiyel gen analizi
🧪 Variant calling, SNP analizleri, mutasyon taramaları
🔢 Biyolojik ağ ve yolak (pathway) analizleri
🧩 Protein-protein etkileşim haritaları
📊 İstatistiksel analiz (R, Python, SPSS)
🧠 Makine öğrenmesi destekli veri modelleme ve sınıflandırma
🧬 Moleküler docking, moleküler dinamik simülasyonları
🛠️ Kullandığımız Araçlar ve Platformlar
Bioinformatics: Galaxy, DAVID, STRING
Veri analizi: R, Python, PremPS , SPSS
Görselleştirme: Heatmap, Origin, Volcano plot, Clustermap
Moleküler modelleme: VMD, PyMOL
🧭 Araştırmacıya Uyumlu ve Yayına Hazır
Her proje farklıdır. Bu nedenle analiz süreçlerimizi, projenizin hipotezine, deneysel tasarımına ve veri formatına göre özelleştiriyoruz. Hedefimiz yalnızca analiz yapmak değil; anlamlı sonuçlar üretmek ve bunları bilimsel yayına uygun şekilde raporlamaktır.
İsterseniz yalnızca ham veriyi paylaşın, gerisini biz yönetelim: veri temizleme, normalizasyon, analiz, istatistiksel testler ve görselleştirme dahil olmak üzere tüm süreci profesyonelce yürütüyoruz.
Diferansiyel gen ekspresyonu, omik veriler ve ötesi
Omik teknolojilerle üretilen büyük biyolojik veri setleri — özellikle RNA-Seq, microarray ve WGS — yalnızca uygun istatistiksel yöntemlerle anlam kazanır. Diferansiyel gen ekspresyonu (DGE) analizleri, biyolojik değişimleri hassas şekilde saptayarak hastalık mekanizmalarını, biyobelirteçleri ve tedavi hedeflerini aydınlatır.
Kurum olarak, genetik ve transkriptomik çalışmalara özel, R tabanlı biyoinformatik ve istatistiksel analiz hizmetleri sunuyoruz. Projelerinize hem teknik derinlik hem de yayın kalitesinde veri çıktısı sağlıyoruz.
Uzmanlık Alanlarımız
🔬 Diferansiyel Gen Ekspresyonu Analizi (DGE)
-DESeq2, edgeR, limma paketleri ile normalize edilmiş sayım verisi üzerinden DGE hesaplama
-Fold change, p-adj, dispersion, MA-plot ve volcano plot üretimi
-Gen filtresi ve kalite kontrol adımları (QC)
📊 Veri Görselleştirme ve İstatistiksel Sunum
-ggplot2, pheatmap, EnhancedVolcano, ComplexHeatmap ile detaylı ve özelleştirilebilir grafikler
-PCA, clustering (hiyerarşik/k-means), ısı haritaları
-GO/KEGG pathway zenginleştirme analizleri (clusterProfiler, enrichR)
🧬 Çoklu Hizalama ve Sekans Analizleri
-msa, Biostrings, DECIPHER ile çoklu hizalama ve motifi bulma
-FASTA/FASTQ veri işleme ve sekans bazlı karşılaştırmalar
-Phylogenetik ağaç çizimi ve benzerlik analizleri
🤝 Bilişimde Güçlü Partnerlik
Projenizin biyoinformatik boyutunu güçlendirmek, yüksek hacimli verileri anlamlandırmak ya da yayına uygun görselleştirmeler üretmek istiyorsanız, size özel danışmanlık ve teknik analiz desteği sunmaya hazırız.